Η Ιατρική Υπηρεσία του Νοσκομείου Άρτας διαρθρώνεται σε τομείς. Στους τομείς αυτούς ανήκουν τμήματα και μονάδες καθώς επίσης υπάρχουν και διατομεακά τμήματα και λοιπά τμήματα.
Η ακριβής διάρθρωση, βάση του ισχύοντα οργανισμού του Νοσοκομείου φαίνεται πιο κάτω:
- Παθολογικός, με δυναμικότητα 152 κλινών
- Χειρουργικός, με δυναμικότητα 149 κλινών
- Εργαστηριακός
- Ψυχικής Υγείας, με δυναμικότητα 9 κλινών
- Δημόσιας Υγείας
Στους τομείς λειτουργούν τακικά Εξωτερικά Ιατρεία αντιστοίχων ειδικοτήτων με τις ειδικότητες των γιατρών που υπηρετούν. Ο αριθμός των Εξωτρικών Ιατρείων καθορίζεται κάθε φορά με απόφαση του Διοκητή του Νοσοκομείου.
Αυτή την στιγμή λειτουργούν τα πιο κάτω Εξωτερικά Ιατρεία:
- Παθολογικό
- Καρδιολογικό
- Υπερήχων καρδιάς
- Πνευμονολογικό
- Παιδιατρικό
- Γαστρεντερολογικό
- Ορθοπαιδικό
- Νεφρολογικό
- Νευροχειρουργικό
- Νευρολογικό
- Οδοντιατρικό
- Χειρουργικό
- Ψυχιατρικό
- Ωτορινολαρυγγολογικό
- Ουρολογικό
- Ανδρολογικό
- Οφθαλμολογικό – Οπτικά πεδία
- Μαιευτικό
