Στην Ιατρική Υπηρεσία λειτουργούν σαν διατομεακά τα τμήματα:

• Ημερήσιας Νοσηλείας

και 

• το αυτοτελές Τμήμα Επειγόντων Περιστατικών (ΤΕΠ)

Επίσης στην Ιατρική Υπηρεσία ανήκουν και τα τμήματα:

• Παραϊατρικού προσωπικού
• Κοινωνικής Εργασίας
• Διαιτολογίας – Διατροφής

Ο Τομέας Δημόσιας Υγείας περιλαμβάνει 

• το τμήμα πρόληψης και προαγωγής υγείας

και

• το τμήμα ιατρικής της εργασίας

Ο Τομέας Ψυχικής Υγείας περιλαμβάνει

•  το Ψυχιατρικό τμήμα

καθώς και

• τις δομές του προγράμματος “ΨΥΧΑΡΓΩΣ”.

Ο Εργαστηριακός Τομέας περιλαμβάνει τα πιο κάτω τμήματα

• Μικροβιολογικό
• Παθολογικής Ανατομικής
• Κυτταρολογικό
• Βιοχημικό
• Αιματολογικό
• Αιμοδοσίας
• Ακτινοδιαγνωστικό
• Αξονικός Τομογραφίας
• Φαρμακευτικό
• Ιατρικής Φυσικής
• Ανοσολογικό

Ο Χειρουργικός Τομέας έχει δυναμικότητα 149 κλινών και περιλαμβάνει τα πιο κάτω τμήματα και μονάδες

Τμήματα

• Γενικής Χειρουργικής
• Ορθοπαιδικό
• Ουρολογικό
• Οφθαλμολογικό
• Ωτορινολαρυγγολογικό
• Γυναικολογικό – Μαιευτικό
• Αναισθησιολογικό
• Οδοντιατρικό
• Νευροχειρουργικό
• Γναθοχειρουργικό

Μονάδες

• Μονάδα Εντατικής Θεραπείας (Μ.Ε.Θ., δυναμικότητας 7 κλινών)
• Μεταναισθητικής Φροντίδας ( Μ.Μ.Α.Φ.)